מצטער שאני מציף את הפורום בבעיות

אז ככה:
במצב שבו הנקודה האחרונה מופיעה מיד אחרי התו @, הערך של המשתנה intLastDotLocation יהיה הערך של המשתנה intLastDotLocation+1.
מכיון שאתה חייב לפחות תו אחד בין ה @ לנקודה שאחריו, הוספתי לתנאי 2+.

עכשיו זה ברור?

מה זאת אומרת "לא עובד"?
אתה חייב להבין שהתיאור "לא עובד" לא נותן לאף אחד שום משג על מה קורה כשאתה מנסה להפעיל את הפונקציה.
אם לא תתאר את מה שקורה באופן מדוייק, אי אפשר יהיה להבין מה קורה שם.

במקרה הזה, היא מיותרת.
השימוש בה צריך להיות, אם כבר, אך ורק בתור ערך של המאפיין href של לינק:

<a href="javascript:func()"> bla bla </a>

מה שהיא עושה בעצם זה אומרת לדפדפן שבמקום לגשת ל URL, הוא צריך לגשת לפונקציה של javascript שנקראת func.

ד"א, לא מומלץ להשתמש בלינק כדי לבצע דבר כזה. עדיף להשתמש במיכל כלשהו (span או div, לדוגמא) שיקרא לביצוע של javascript ב onClick. אם אתה ממש רוצה שזה יראה כמו לינק, זה לא בעיה בכלל ב css לגרום לתוכן של תג להראות כמו לינק.

החלק העצוב בעניין,
הוא שלפי איך שנראה לי, לפחות, רוב השאלות שלך בפורום הזה הן כאלה שתוכל למצוא את התשובה להן לבד, אם רק קצת תטרח לחשוב.

לא בדיוק אבל בערך.
בכלל, אני לא מצליח להבין את הרעיון של זה:

flag=true
return

כשאפשר פשוט לכתוב return true ולגמור סיפור בשורה אחת.
הכיון של תנאי הוא אכן נכון, אבל הכוונה שלי היתה טיפה אחרת:

// if the user entered an ICQ number
if(icq.length>0) {
if (icq.length !=9){
alert('מספר ICQ חייב להיות בדיוק 9 ספרות')
document.SignUp.ICQ.focus()
flag=false
return
}else{
if(isNaN(icq) == true){
alert("טעות בשדה ICQ.הקלדת אותיות היכן שצריך להקליד מספרים")
document.SignUp.ICQ.focus()
flag=false
return
}
}
}